emdomic.

DOI：10.18129 / b9.bioc.emomics.

地球移动器对基因组学数据差异分析的距离

Bioconductor版本：释放（3.13）

EMDOMICS算法用于执行监督的多级分析，以测量观察到的群体之间观察到的连续基因组学数据的统计显着性。通常，数据将是来自阵列的基于阵列的基因表达值的基因表达值，但是也可以分析来自其他类型的实验的数据（例如，拷贝数变化）。传统方法，如微阵列（SAM）和微阵列数据的线性模型的重要性分析（利马）使用基于分布的概要统计（均值和标准偏差）的重要性测试。这种方法缺乏能力识别显示高水平的基团内异质性的组之间的表达差异。地球移动器的距离（EMD）算法代替计算将一个分布转换为另一个分布所需的“工作”，从而提供两个分布之间的形状的整体差异的度量。示例标签的置换用于为观察到的EMD分数生成Q值。该套件还采用了Komolgorov-Smirnov（K-S）测试和Cramer Von Mises测试（CVM），这是普通分布比较测试。

作者：Sadhika Malladi [Aut，Cre]，Daniel Schmolze [Aut，Cre]，Andrew Beck [Aut]，Sheida Nabavi [Aut]

维护者：Sadhika Malladi Daniel Schmolze

安装

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细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	2.22.0
在生物导体中以来	BIOC 3.1（R-3.2）（6年）
执照	mit +文件执照
依靠	r（> = 3.2.1）
进口	Emdist.那生物相投那MatrixStats.那ggplot2.那CDFT.那预处理核
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源包	emdomics_2.22.0.tar.gz.
Windows二进制文件	emdomics_2.22.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	emdomics_2.22.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/emdomics.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ emdomics
包短网址	https://biocumon.org/packages/emdomics/
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