Dropletuls.

DOI：10.18129 / b9.bioc.dropletutils.

处理单单元液滴数据的实用程序

Bioconductor版本：释放（3.13）

提供许多用于处理来自10x基因组学等液滴技术的单个小区（RNA-SEQ）数据的实用程序功能。这包括从计数矩阵或分子信息文件的数据加载，从空液滴识别细胞，除去条形码交换的伪细胞，以及计数矩阵的下采样。

作者：Aaron LUN [AUT，CRE]，Jonathan Griffiths [CTB]，Davis McCarthy [CTB]

维护者：Aaron LUN

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“dropletutils”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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Browsevignettes（“Dropletuls”）

HTML.	r script.	处理基于液滴的单细胞RNA-SEQ数据的实用程序
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细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	1.12.1
在生物导体中以来	BIOC 3.7（R-3.5）（3年）
执照	GPL-3
依靠	SinglecellexPeriment.
进口	Utils，stats，方法，矩阵那rcpp.那生物根系那S4Vectors.那概括分析那生物相投那delayedarray那delayedmatrixstats那HDF5Array.那RHDF5.那edger.那R.utils.那DQRNG.那海滩日那sc
链接到	rcpp.那海滩日那RHDF5LIB.那BH.那DQRNG.那sc
建议	testthat.那kn那生物焦那RAMAMAMDOW.那雅思石那droplettestfiles.
系统要求	C ++ 11，GNU制作
加强
URL.
取决于我	Osca.advanced，OSCA.Intro，OSCA.Multisample，OSCA.Workflows
进口我	SCCB2.那singlecelltk.那西班牙猎犬那Spatiamesxperiment.
建议我	droplettestfiles.那穆斯萨那穆斯科塔那空白山脉
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	dropletuls_1.12.1.tar.gz.
Windows二进制文件	dropletuls_1.12.1.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	dropletuls_1.12.1.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/dropletutils.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包裹/滴剂
包短网址	https://biocumon.org/packages/dropletutils/
包裹下载报告	下载统计信息
BIOC 3.13的旧源包	源档案