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DegNorm
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DOI:10.18129 / B9.bioc.DegNorm
DegNorm:退化为RNA-seq数据规范化
Bioconductor版本:版本(3.13)
这个包执行退化正常化散装RNA-seq数据以改进微分表达式分析精度。
作者:王本熊和中正
维护人员:王中正大学< jzwang northwestern.edu >
从内部引用(R,回车引用(“DegNorm”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DegNorm”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“DegNorm”)
| HTML | R脚本 | DegNorm |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
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| 版本 | 1.2.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.12 (r - 4.0)(0.5年) |
| 许可证 | LGPL (> = 3) |
| 取决于 | R(> = 4.0.0)方法 |
| 进口 | Rcpp(> = 1.0.2中),GenomicFeatures平行,foreach,S4Vectors,doParallel,Rsamtools(> = 1.31.2),GenomicAlignments,的热图,data.table统计数据,ggplot2,GenomicRanges,IRanges,plyr,情节跑龙套,冬青 |
| 链接 | Rcpp,RcppArmadillo,S4Vectors,IRanges |
| 建议 | knitr,rmarkdown,formatR |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/jipingw/DegNorm/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | DegNorm_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | DegNorm_1.2.0.zip(32位和64位) |
| macOS 10.13(高山脉) | DegNorm_1.2.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DegNorm |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DegNorm |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DegNorm/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
