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DeconRNASeq
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DOI:10.18129 / B9.bioc.DeconRNASeq
反褶积mRNA-Seq异构组织样本的数据
Bioconductor版本:版本(3.16)
DeconSeq R包反褶积的异构组织基于mRNA-Seq数据。从异构建模表达水平细胞种群mRNA-Seq加权平均的表达式不同构成的细胞类型和预测细胞类型比例的单一的表达谱。
作者:Ting锣< tinggong gmail.com >约瑟夫·d·Szustakowski <约瑟夫。在novartis.com szustakowski >
维修工:Ting锣< tinggong gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“DeconRNASeq”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DeconRNASeq”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“DeconRNASeq”)
| R脚本 | DeconRNASeq演示 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.40.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(10.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 2.14.0),limSolve,pcaMethods,ggplot2、网格 |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | 适应 |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | DeconRNASeq_1.40.0.tar.gz |
| Windows二进制 | DeconRNASeq_1.40.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | DeconRNASeq_1.40.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | DeconRNASeq_1.40.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DeconRNASeq |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DeconRNASeq |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/DeconRNASeq/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DeconRNASeq/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
