DSS

doi:10.18129/b9.bioc.dss

测序数据的分散收缩

生物导体版本:版本(3.13)

DSS是一个R库,对基于计数的测序数据进行不同的分析。它从RNA-Seq检测到差异表达的基因(DEG),并从甲基化的基因座或区域(DML/DMR)中检测到亚硫酸盐测序(BS-SEQ)。DSS的核心是一种新的分散收缩方法,用于估算γ-波森或β-二比分布的分散参数。

作者:hao wu ,hao feng

维护者:hao wu ,hao feng

引用(从r内,输入引用(“ DSS”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ dss”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ DSS”)

html R脚本 DSS用户指南
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 2.40.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(8。5年)
执照 GPL
要看 R(> = 3.3),方法,生物酶,,,,生物比较,,,,BSSEQ
进口 UTIT,图形,统计,花纹,延迟
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
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取决于我
进口我 dmrcate,,,,,,,,metaseqr2,,,,Methcp,,,,甲基化
建议我 饼干,,,,Methrix,,,,纳米塞维兹,,,,恰当的
链接到我
构建报告

包装档案

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源包 DSS_2.40.0.tar.gz
Windows二进制 dss_2.40.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) dss_2.40.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dss
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/dss
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/dss/
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