dnashaper

doi:10.18129/b9.bioc.dnashaper

DNA形状特征的高通量预测

生物导体版本:版本(3.15)

DNAHAPER是R/生物导体包装,用于对DNA形状特征的超快速,高通量预测。该软件包允许预测,可视化和编码用于统计学习的DNA形状特征。

作者:Tsu-Pei Chiu和Federico Comoglio

维护者:usc.edu>的tsu-pei chiu

引用(从r内,输入引用(“ dnashaper”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ dnashaper”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ dnashaper”)

html R脚本 dnashaper
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.24.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(6年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.4),基因组机
进口 RCPP(> = 0.12.1),生物弦,,,,字段
链接 RCPP
建议 AnnotationHub,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,BSGENOME.SCEREVISIAE.UCSC.SACCER3,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,商在
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 dnashaper_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 dnashaper_1.24.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) dnashaper_1.24.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dnashaper
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/dnashaper
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/dnashaper/
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