生物导体版本:版本(3.15)
DMRFORPAIRS(以前是DMR2+)允许研究人员在其甲基化剖面方面比较N> = 2个独特的样品。N唯一单样品的(成对)比较将DMRForpairs与其他现有管道区分开,因为这些通常会比较单个CPG基因座或基于区域的分析中的样品组。dmrforpairs将感兴趣的区域定义为基因组范围,彼此之间有足够的探针。一个区域中的探针可选地注释到同一功能类别。通过比较单个样品之间的每个区域内的甲基化值,并且(如果差异足够大)来评估差异甲基化,从而正式测试了该差异的统计显着性。
作者:Martin Rijlaarsdam [AUT,CRE],Yvonne VD Zwan [aut],Lambert Dorssers [aut],Leendert Looijenga [aut]
维护者:Martin Rijlaarsdam
引用(从r内,输入引用(“ dmrforpairs”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ dmrforpairs”)
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browsevignettes(“ dmrforpairs”)
R脚本 | dmrforpairs_vignette | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.32.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.14(R-3.1)(8年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 2.15.2),GVIZ(> = 1.2.1),R2HTML(> = 2.2.1),基因组机(> = 1.10.7),并行 |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.martinrijlaarsdam.nlhttp://www.erasmusmc.nl/pathologie/research/lepo/3898639/ |
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源包 | dmrforpairs_1.32.0.tar.gz |
Windows二进制 | dmrforpairs_1.32.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | dmrforpairs_1.32.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dmrforpairs |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/dmrforpairs |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/dmrforpairs/ |
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