dmrforpairs

doi:10.18129/b9.bioc.dmrforpairs

DMRFORPAIRS:使用阵列基甲基化曲线识别唯一样品之间差异甲基化区域

生物导体版本:版本(3.15)

DMRFORPAIRS(以前是DMR2+)允许研究人员在其甲基化剖面方面比较N> = 2个独特的样品。N唯一单样品的(成对)比较将DMRForpairs与其他现有管道区分开,因为这些通常会比较单个CPG基因座或基于区域的分析中的样品组。dmrforpairs将感兴趣的区域定义为基因组范围,彼此之间有足够的探针。一个区域中的探针可选地注释到同一功能类别。通过比较单个样品之间的每个区域内的甲基化值,并且(如果差异足够大)来评估差异甲基化,从而正式测试了该差异的统计显着性。

作者:Martin Rijlaarsdam [AUT,CRE],Yvonne VD Zwan [aut],Lambert Dorssers [aut],Leendert Looijenga [aut]

维护者:Martin Rijlaarsdam

引用(从r内,输入引用(“ dmrforpairs”)):

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if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ dmrforpairs”)

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源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/dmrforpairs
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