DMRCALLER
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.dmrcaller
差异甲基化区域
生物导体版本：版本（3.15）
在两个条件下使用硫甘硫酸盐测序数据，并确定CG和非CG环境中条件之间的差异甲基化区域。输入是Bismark生成的CX报告文件，输出是存储为Granges对象的DMR列表。
作者：Nicolae Radu Zabet
维护者：nicolae radu zabet
引用（从r内，输入引用（“ dmrcaller”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ dmrcaller”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ dmrcaller”）
| R脚本 | DMRCALLER | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.28.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1（R-3.2）（7年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.5），基因组机，，，，iranges，，，，S4VECTORS（> = 0.23.10） |
| 进口 | 平行，RCPP，，，，rcpproll，，，，betareg，grdevices，图形，方法，统计，utils |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，运行，，，，生物基因 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | dmrcaller_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | dmrcaller_1.28.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | dmrcaller_1.28.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dmrcaller |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/dmrcaller |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/dmrcaller/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
