DIAlignR

DOI:10.18129 / B9.bioc.DIAlignR

基于动态规划的一致性一色谱

Bioconductor版本:版本(3.13)

获得公正的蛋白质组覆盖从生物样品,质谱仪操作在数据独立收购(DIA)模式。对齐的DIA运行建立一致性和不完整的数据矩阵中的遗漏值。这个方案实现了动态规划和基于仿射点球差距的方法分析物的两两对齐。混合全局比对的方法(通过一份功能)和局部比对(一份色谱)中实现这个工具。

作者:Shubham Gupta < Shubham。1637年gmail.com >,Hannes Rost

维护人员:Shubham Gupta < Shubham。1637年gmail.com >

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HTML	R脚本	一份基于色谱质谱仪对齐目标运行
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	2.0.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	方法、统计、R (> = 4.0)
进口	动物园(1.8 > = 3),data.table,magrittr,dplyr,tidyr,rlang,mzR(> = 2.18),信号,bit64,网状,ggplot2,RSQLite,DBI,猿,phangorn,pracma,RMSNumpress,Rcpp
链接	Rcpp,RcppEigen
建议	knitr,akima,晶格,尺度,gridExtra,latticeExtra,rmarkdown,BiocStyle,BiocParallel,testthat(> = 2.1.0的)
SystemRequirements	c++ 14
增强了
URL
BugReports	https://github.com/shubham1637/DIAlignR/issues
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源包	DIAlignR_2.0.0.tar.gz
Windows二进制	DIAlignR_2.0.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	DIAlignR_2.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DIAlignR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DIAlignR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DIAlignR/
包下载报告	下载数据