Desubs

doi：10.18129/b9.bioc.desubs

Desubs：使用RNA-Seq表达实验灵活识别差异表达的子路的R包装

生物导体版本：版本（3.15）

Desubs是一个基于网络的系统生物学软件包，它在RNA-Seq实验记录的路径网络中提取疾病扰动的子路。它包含一个广泛且可定制的框架，涵盖了子路口分析的各个阶段的广泛操作模式，从而实现了特定于案例的方法。操作模式是指有关各种生物学和药理特征的路径网络构建和处理，子路口提取，可视化和富集分析。它的功能使其成为建模者和实验者的工具指导，以识别更健壮的系统级生物标志物来用于复杂疾病。

作者：Aristidis G. Vrahatis和Panos Balomenos

维护者：Aristidis G. Vrahatis ，panos balomenos

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Desubs”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Desubs”）

PDF	R脚本	Desubs
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载
版本	1.22.0
在生物导体中	Bioc 3.4（R-3.3）（5。5年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 3.3），Locfit
进口	图形，，，，Igraph，，，，rbgl，，，，循环，，，，林玛，，，，EDGER，，，，EBSEQ，，，，NBPSEQ，统计，grdevices，图形，pheatmap，utils，GGPLOT2，，，，矩阵，，，，jsonlite， 工具，deseq2， 方法
链接
建议	运行，，，，生物基因，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Desubs_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	Desubs_1.22.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	Desubs_1.22.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/desubs
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/desubs
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/desubs/
软件包下载报告	下载统计