Desingle.

DOI：10.18129 / b9.bioc.desingle.

Disingle检测单细胞RNA-SEQ数据中三种类型的差异表达

Bioconductor版本：释放（3.13）

Disingle是用于单细胞RNA-SEQ（SCRNA-SEQ）数据的差异表达（DE）分析的R包。它在两组单细胞之间定义和检测3种类型的差异表达基因，关于不同的表达状态（DES），差异表达丰度（DEA）和一般差异表达（DEG）。Desingle采用零充气的负二进制型来估计真实和辍学零的比例并定义和检测3种类型的DE基因。结果表明，Desingle优于ScrNA-SEQ DE分析的现有方法，并且可以揭示富含不同生物功能的不同类型的DE基因。

作者：Zhun Miao

维护者：Thun Miao

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percenamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“desingle”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	1.12.0
在生物导体中以来	BIOC 3.7（R-3.5）（3年）
执照	GPL-2
依靠	r（> = 3.4.0）
进口	统计数据，矩阵（> = 1.2-14），大量的（> = 7.3-45），vgam.（> = 1.0-2），BBMLE.（> = 1.0.18），Gamls.（> = 4.4-0），Maxlik.（> = 1.3-4），PSCL.（> = 1.4.9），生物相投（> = 1.12.0）
链接到
建议	kn那RAMAMAMDOW.那SinglecellexPeriment.
系统要求
加强
URL.	https://miaozhun.github.io/desingle/
取决于我
进口我	Irisfgm.
建议我
链接给我
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包档案包

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源包	desingle_1.12.0.tar.gz.
Windows二进制文件	desingle_1.12.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	desingle_1.12.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/desingle.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/ desingle
包短网址	https://biocumon.org/packages/desingle/
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