DEQMS.

DOI：10.18129 / b9.bioc.deqms.

一种对定量蛋白质组学数据进行差异蛋白表达进行统计分析的工具。

Bioconductor版本：释放（3.13）

DEQMS在LIMMA之上开发。然而，雷玛假设所有基因的先前差异。在蛋白质组学中，蛋白质丰度估计的准确性因无标记和标记数据中量化的肽/ psm的数量而变化。蛋白质通过多种肽或PSM进行量化更准确。DEQMS包能够估计通过不同数量的PSM /肽量化的蛋白质的不同现有差异，因此可以采用更好的准确性。包装可以应用于分析无标记和标记的蛋白质组学数据。

作者：Yafeng朱

维护者：Yafeng Zhu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！properenamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“deqms”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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HTML.	r script.	DEQMS R Markdown Vignettes
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细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	1.10.0
在生物导体中以来	BIOC 3.8（R-3.5）（2.5岁）
执照	LGPL.
依靠	R（> = 3.5），图形，统计数据，ggplot2.那林马（> = 3.34）
进口
链接到
建议	生物焦那kn那RAMAMAMDOW.那普利尔那MatrixStats.那重塑2.那农场，实用，GGRepel.那实验室那LSD.
系统要求
加强
URL.
Bugreports.	https://github.com/yafeng/deqms/issues.
取决于我
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包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	deqms_1.10.0.tar.gz.
Windows二进制文件	deqms_1.10.0.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	deqms_1.10.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/deqms.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包/ deqms
包短网址	https://biocumon.org/packages/deqms/
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