Dewseq

doi:10.18129/b9.bioc.dewseq

基于负二项式分布的差分表达的窗口

生物导体版本:版本(3.15)

DeWseq是分析差异富集结合区域的滑动窗口方法,或ICLIP下一代测序数据。

作者:Sudeep Sahadevan [aut],Thomas Schwarzl [aut],生物信息学团队Hentze [AUT,CRE]

维护者:hentze 的生​​物信息学团队

引用(从r内,输入引用(“ dewseq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ dewseq”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ dewseq”)

html R脚本 用deWseq分析Eclip/ICLIP数据
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(2。5年)
执照 LGPL(> = 3)
要看 r(> = 4.0.0),r.utils,,,,deseq2,,,,生物比较
进口 生物基因,,,,Data.Table(> = 1.11.8),GenomeInfodB,,,,基因组机, 方法,S4VECTORS,,,,总结性特征,统计,utils
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,生物使用,,,,ihw
系统要求
增强
URL https://github.com/embl-hentze-group/dewseq/
BugReports https://github.com/embl-hentze-group/dewseq/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 dewseq_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 dewseq_1.10.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) dewseq_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dewseq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/dewseq
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/dewseq/
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