DegReport
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doi：10.18129/b9.bioc.degreport
DEG分析报告
生物导体版本：版本（3.13）
创建计数数据差异表达分析的HTML报告。它集成了DESEQ2和Edger Vignettes中提到的一些代码，并根据每个选定基因的折叠变化均值和可变性报告基因的排名列表。
作者：Lorena Pantano [AUT，CRE]，John Hutchinson [CTB]，Victor Barrera [CTB]，Mary Piper [CTB]，Radhika Khetani [CTB]，Kenneth Daily [CTB]，Thanneer Malai Malai Perumal [CTB]，Rory Kirchner [Rory Kirchner [CTB]，Michael Steinbaugh [CTB]
维护者：lorena pantano
引用（从r内，输入引用（“ DegReport”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ degReport”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ DegReport”）
| html | R脚本 | QC和下游分析用于差异表达RNA-Seq |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.28.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（6。5年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | R（> = 3.6.0） |
| 进口 | UTIT，方法，生物酶，，，，生物基因，，，，扫帚，，，，循环，，，，复杂的图像，，，，牛仔图，，，，共识ClusterPlus，，，，簇，，，，deseq2，，，，dplyr，，，，EDGER，，，，GGPLOT2，，，，ggdendro， 网格，Ggrepel，grdevices，尼特，，，，记录，，，，拉索2，，，，马格里特，，，，喷嘴.r1，，，，心理，，，，rcolorbrewer，，，，重塑，，，，rlang，，，，秤，统计Stringr，，，，S4VECTORS，，，，总结性特征，，，，花花公子，，，，蒂布尔 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，AnnotationDbi，，，，林玛，，，，pheatmap，，，，rmarkDown，，，，Statmod，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://lpantano.github.io/degreport/ |
| BugReports | https://github.com/lpantano/degreport/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | Isomirs |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | degReport_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | degReport_1.28.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | degReport_1.28.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/degreport |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/degReport |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/degreport/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
