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反编排
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DOI:10.18129 / B9.bioc.DEFormats
差异基因表达数据格式转换器
Bioconductor版本:版本(3.15)
所使用的不同数据格式之间的转换差异基因表达分析工具。
作者:Andrzej Oleś
维护人员:Andrzej Oleś< Andrzej。ole在embl.de >
从内部引用(R,回车引用(“反编排”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“反编排”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“反编排”)
| HTML | R脚本 | 差异基因表达数据格式转换器 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.24.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(6年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | |
| 进口 | 使彻底失败,data.table,DESeq2,刨边机(> = 3.13.4),GenomicRanges、方法、S4Vectors统计数据,SummarizedExperiment |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle(> = 1.8.0),knitr,rmarkdown,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/aoles/DEFormats |
| BugReports | https://github.com/aoles/DEFormats/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | regionReport |
| 建议我 | 理想的 |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | DEFormats_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | DEFormats_1.24.0.zip(64位) |
| macOS 10.13(高山脉) | DEFormats_1.24.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DEFormats |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/反编排 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DEFormats/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
