细胞瘤

doi:10.18129/b9.bioc.cytoml

跨平台细胞仪数据共享的门控件接口

生物导体版本:版本(3.13)

使用GatingML2.0标准的平台特异性启动来与其他软件平台交换门控细胞仪数据。

作者:迈克·江,杰克·瓦格纳

维护者:Mike Jiang

引用(从r内,输入引用(“ Cytoml”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ cytoml”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Cytoml”)

html R脚本 Flowjo解析器
html R脚本 如何将gatingset导出到门控
html R脚本 如何将细胞库导入Gatingset
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载
版本 2.4.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(4。5年)
执照 文件执照
要看 R(> = 3.5.0)
进口 Cytolib(> = 2.3.9),流核(> = 1.99.10),FlowWorkspace(> = 4.1.8),opencyto(> = 1.99.2),XML,,,,Data.Table,,,,jsonlite,,,,rbgl,,,,rgraphviz,,,,生物酶, 方法,图形,图形,utils,base64enc,,,,plyr,,,,dplyr,grdevices,方法,ggcyto(> = 1.11.4),Yaml,,,,格子,统计公司,,,,运行,,,,蒂布尔,,,,rcppparallel,,,,XML2
链接 RCPP,,,,BH(> = 1.62.0-1),rprotobuflib,,,,Cytolib,,,,Rhdf5lib,,,,rcpparmadillo,,,,rcppparallel(> = 4.4.2-1),FlowWorkspace
建议 测试,,,,FlowWorkspacedata,,,,尼特, 平行
系统要求 XML2,GNU MAKE,C ++ 11
增强
URL https://github.com/rglab/cytoml
BugReports https://github.com/rglab/cytoml/issues
取决于我
进口我 流动
建议我 FlowWorkspace,,,,opencyto
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Cytoml_2.4.0.tar.gz
Windows二进制 cytoml_2.4.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Cytoml_2.4.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cytoml
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/cytoml
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/cytoml/
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