生物导体版本:版本(3.15)
CRISPRVARIANTS提供了分析CRISPR-CAS9诱变测序实验的结果或其他测序实验的工具,在给定区域内的变体中引起了人们的关注。这些工具使用户可以针对任何基因组位置(例如CAS9切割位点),绘制等位基因组合并通过灵活过滤无关变体的灵活过滤来定位变体等位基因组合。
作者:海伦·林赛[AUT,CRE]
维护者:Helen Lindsay
引用(从r内,输入引用(“ crisprvariants”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ CRISPRVARIANTS”)
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Browsevignettes(“ Crisprvariants”)
R脚本 | crisprvariants | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.24.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(6年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | r(> = 3.5),GGPLOT2(> = 2.2.0) |
进口 | AnnotationDbi,,,,生物比较,,,,生物弦, 方法,GenomeInfodB,,,,基因组签名,,,,基因组机,grdevices,网格,栅格,,,,iranges,,,,RESHAPE2,,,,rsamtools,,,,S4VECTORS(> = 0.9.38),UTILS |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,gdata,,,,GenomicFeatures,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,rtracklayer,,,,Sangerseqr,,,,测试,,,,变体 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | crisprvariants_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | crisprvariants_1.24.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | crisprvariants_1.24.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/crisprvariants |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/crisprvariants |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/crisprvariants/ |
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