CountClust

DOI:10.18129 / B9.bioc.CountClust

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利用隶属度模型的聚类和可视化RNA-Seq表达数据

Bioconductor版本:Release (3.15)

将隶属度等级模型(GoM，也称为混合模型)拟合到聚类RNA-seq基因表达计数数据中，识别驱动聚类隶属度的特征基因，并提供聚类隶属度的可视化摘要。

作者:Kushal Dey [aut, cre]， Joyce Hsiao [aut]， Matthew Stephens [aut]

维护者:Kushal Dey

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

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版本	1.23.1
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(6.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.4)，ggplot2(> = 2.1.0的)
进口	SQUAREM，大满贯，maptpx，plyr(> = 1.7.1上),cowplot，gtools，flexmix，激情似火，limma平行,reshape2，统计，utils，图形，grDevices
链接
建议	knitr，kableExtra，BiocStyle，Biobase，roxygen2，RColorBrewer，devtools，xtable
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/kkdey/CountClust
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

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源包
Windows二进制	CountClust_1.23.1.zip
macOS二进制文件(x86_64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CountClust
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CountClust
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CountClust/
软件包下载报告	下载数据