coregx

doi:10.18129/b9.bioc.coregx

作为其他“ GX”软件包的基础的课程和功能

生物导体版本:版本(3.15)

功能和类的集合,是我们实验室的R套件套件的基础,例如“ Pharmacogx”和“ Radiogx”。该软件包的创建是为了从其他实验室包发行的抽象共享功能中抽象共享功能,以提高可维护性的易于性并减少当前和未来的“ GX”套件程序中的代码重复。主要功能包括“核心”类,从中得出“辐射组合”和“药物”,以及每个相应插槽的GET和设置方法。包括与拟合和绘制剂量响应曲线,量化统计相关性以及曲线(AUC)或生存分数(SF)下的统计相关性和计算面积有关的其他功能。有关更多详细信息,请参阅包括的文档,以及:Smirnov,P。,Safikhani,Z.,El-Hachem,N.,Wang,D.,She,A.,Olsen,C.,Freeman,M.,Selby,H.,Gendoo,D.,Grossman,P.,Beck,A.,Aerts,H.,Lupien,M.,Goldenberg,A。(2015年) 。Manem,V.,Labie,M.,Smirnov,P.,Kofia,V.,Freeman,M.,Koritzinksy,M.,Abazeed,M.,Haibe-Kains,B.,Bratman,S。(2018)(2018年)

作者:Petr Smirnov [Aut],Ian Smith [AUT],Christopher Eeles [Aut],Benjamin Haibe-Kains [AUT,CRE]

维护者:本杰明·海布·卡因斯

引用(从r内,输入引用(“ coregx”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ coregx”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ coregx”)

html R脚本 CoreGX:类和功能抽象
html R脚本 长期班级
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 2.0.2
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(2。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 4.1),生物基因,,,,总结性特征
进口 生物酶,,,,S4VECTORS,,,,多亚sayExexperiment,,,,矩阵,,,,钢琴,,,,生物比较, 平行,bumpymatrix,,,,检查员,方法,统计,utils,图形,grdevices,LSA,,,,Data.Table,,,,蜡笔,,,,胶水,,,,rlang,,,,长椅
链接
建议 潘德,,,,降价,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,尼特,,,,格式,,,,测试
系统要求
增强
URL
取决于我 Pharmacogx,,,,Radiogx,,,,有毒
进口我 pdatk
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 coregx_2.0.2.tar.gz
Windows二进制 coregx_2.0.2.2
MacOS 10.13(高山脉) coregx_2.0.2.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/coregx
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/coregx
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/coregx/
软件包下载报告 下载统计
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