库务

doi:10.18129/b9.bioc.copynumberplots

使用Karyoploter功能创建复制单图

生物导体版本:版本(3.13)

库务纸具有一组功能,可扩展Karyoploters功能,以创建相关数据的美丽,可定制和灵活的图。

作者:igtp.cat>的Bernat Gel 和Miriam Magallon

维护者:igtp.cat上的bernat凝胶

引用(从r内,输入引用(“库务啤酒”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ coplenumberplots”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Cerynumberplots”)

html R脚本 库务插图小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(2年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.6),核粒子
进口 区域人,,,,iranges,,,,rsamtools,,,,总结性特征,,,,变体,方法,统计,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,CN. -ops,,,,RHDF5,UTILS
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,panelcn.mops,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked,,,,DNACOPIGY,,,,测试
系统要求
增强
URL https://github.com/bernatgel/copynumberplots
BugReports https://github.com/bernatgel/copynumberplots/issues
取决于我
进口我 cnvfilter,,,,CNVIZ
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 coplenumberplots_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 CAYMNUMBERPLOTS_1.8.0.ZIP
MacOS 10.13(高山脉) coplenumberplots_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/copynumberplots
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/copynumberplots
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/copynumberplots/
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