我思

DOI:10.18129 / B9.bioc.Cogito

比较基因组间隔工具-关于基因组和表观基因组数据集的自动化,完整,可重复和清晰的报告

Bioconductor版本:发行版(3.16)

生物学研究通常包括多种条件,这些条件通过不同的实验室设置进行检查,如rna测序或芯片测序。为了获得整个结果数据集的概述,Cogito提供了一个关于所有样本和所有不同样本之间的基本比较的自动化、完整、可重复和清晰的报告。该报告可以用作关于数据集的文档,也可以用作进一步自定义分析的起点。

作者:安妮卡Bürger [cre, aut]

维护者:Annika Bürger

引文(从R内,输入引用(“我思”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“我思”)

超文本标记语言 R脚本 Cogito:比较注释的基因组间隔工具
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文本 新闻

细节

biocViews bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 1.4.0
在Bioconductor bio3.14 (R-4.1)(1年)
许可证 LGPL-3
取决于 R (>= 4.1),GenomicRangesjsonliteGenomicFeatures
进口 BiocManagerrmarkdownGenomeInfoDbS4VectorsAnnotationDbi,图形,统计,utils,方法,magrittrggplot2TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene
链接
建议 BiocStyleknitr减价testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 Cogito_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 Cogito_1.4.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) Cogito_1.4.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) Cogito_1.4.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Cogito
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Cogito
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/Cogito/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Cogito/
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