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芝加哥
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DOI:10.18129 / B9.bioc.Chicago
芝加哥:捕捉高c基因组组织的分析
Bioconductor版本:版本(3.13)
分析获取高c数据的管道。
作者:乔纳森·凯恩斯Paula Freire普里切特,史蒂文Wingett,米哈伊尔•Spivakov
维修工:米哈伊尔Spivakov <米哈伊尔。在lms.mrc.ac.uk spivakov >
从内部引用(R,回车引用(“芝加哥”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(《芝加哥》)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“芝加哥”)
| HTML | R脚本 | 芝加哥的故事 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.3.1),data.table |
| 进口 | matrixStats,质量,Hmisc,Delaporte、方法、grDevices图形、统计、跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | argparse,BiocStyle,knitr,rmarkdown,PCHiCdata,testthat,Rsamtools,GenomicInteractions,GenomicRanges,IRanges,AnnotationHub |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | PCHiCdata |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | Chicago_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Chicago_1.20.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | Chicago_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Chicago |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/芝加哥 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Chicago/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
