ChemmineR

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChemmineR

Cheminformatics R的工具包

Bioconductor版本:版本(3.16)

ChemmineR cheminformatics包分析药物类小分子数据在r .其最新版本包含函数有效地处理大量的分子,物理化学/结构性能预测,结构相似性搜索、分类和聚类的化合物库的广泛的算法。此外,它提供了可视化功能复合聚类结果和化学结构。

作者:y埃迪曹,凯文•霍兰泰勒后方,托马斯Girke

维护人员:托马斯Girke <托马斯。在ucr.edu girke >

从内部引用(R,回车引用(“ChemmineR”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ChemmineR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ChemmineR”)

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版本 3.50.0
Bioconductor自 BioC 2.3 (r - 2.8)(14年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(> = 2.10.0)方法
进口 rjson、图表、数据、RCurl,DBI,消化,BiocGenerics,Rcpp(> = 0.11.0)它,ggplot2、网格gridExtra,png,base64enc,DT,rsvg,jsonlite,stringi
链接 Rcpp,黑洞
建议 RSQLite,scatterplot3d,gplots,fmcsR,,RPostgreSQL,BiocStyle,knitr,knitcitations,knitrBootstrap,ChemmineDrugs,png,rmarkdown,BiocManager,助理
SystemRequirements GNU使
增强了 ChemmineOB
URL https://github.com/girke-lab/ChemmineR
取决于我 ChemmineDrugs,eiR,fmcsR
进口我 bioassayR,CompoundDb,customCMPdb,eiR,fmcsR,MetID,RMassBank
建议我 ChemmineOB
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 ChemmineR_3.50.0.tar.gz
Windows二进制 ChemmineR_3.50.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) ChemmineR_3.50.0.tgz
macOS二进制(arm64) ChemmineR_3.50.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChemmineR
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ChemmineR
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ChemmineR/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ChemmineR/
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