芯片

doi:10.18129/b9.bioc.chipsim

芯片序列实验的仿真

生物导体版本:版本(3.15)

芯片序列数据模拟的一般框架。尽管目前专注于核小体定位,但包装旨在支持不同类型的实验。

作者:彼得·洪堡(Peter Humburg)

维护者:彼得·洪堡(Peter Humburg)

引用(从r内,输入引用(“芯片”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ chipsim”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“芯片”)

PDF R脚本 模拟CHIP-SEQ实验
PDF 参考手册

细节

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版本 1.50.0
在生物导体中 Bioc 2.5(R-2.10)(12。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 生物弦(> = 2.29.2)
进口 iranges,,,,xvector,,,,生物弦,,,,Shortread,图形,方法,统计,utils
链接
建议 算术,,,,动物园
系统要求
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取决于我
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构建报告

包装档案

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源包 chipsim_1.50.0.tar.gz
Windows二进制 chipsim_1.50.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) chipsim_1.50.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipsim
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/芯片
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/chipsim/
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