生物导体版本:版本(3.15)
CHIPSEQR鉴定了CHIP-SEQ和核小体定位实验的蛋白质结合位点。用于描述结合事件的模型是为定位核小体而开发的,但也应足够灵活以处理其他类型的实验。
作者:彼得·洪堡(Peter Humburg)
维护者:彼得·洪堡(Peter Humburg)
引用(从r内,输入引用(“ chipseqr”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ chipseqr”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ chipseqr”)
R脚本 | Chipseqr简介 | |
参考手册 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.50.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.5(R-2.10)(12。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | R(> = 2.10.0),方法,生物基因,,,,S4VECTORS(> = 0.9.25) |
进口 | 生物弦,,,,FBASICS,,,,基因组机,,,,iranges(> = 2.5.14),图形,grdevices,希尔伯特维斯,,,,Shortread,统计蒂姆萨克,UTILS |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | chipseqr_1.50.0.tar.gz |
Windows二进制 | chipseqr_1.50.0.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | chipseqr_1.50.0.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipseqr |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/chipseqr |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/chipseqr/ |
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