chipseqr

doi:10.18129/b9.bioc.chipseqr

在高通量测序数据中识别蛋白质结合位点

生物导体版本:版本(3.15)

CHIPSEQR鉴定了CHIP-SEQ和核小体定位实验的蛋白质结合位点。用于描述结合事件的模型是为定位核小体而开发的,但也应足够灵活以处理其他类型的实验。

作者:彼得·洪堡(Peter Humburg)

维护者:彼得·洪堡(Peter Humburg)

引用(从r内,输入引用(“ chipseqr”)):

安装

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if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ chipseqr”)

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文档

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browsevignettes(“ chipseqr”)

PDF R脚本 Chipseqr简介
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细节

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版本 1.50.0
在生物导体中 Bioc 2.5(R-2.10)(12。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 2.10.0),方法,生物基因,,,,S4VECTORS(> = 0.9.25)
进口 生物弦,,,,FBASICS,,,,基因组机,,,,iranges(> = 2.5.14),图形,grdevices,希尔伯特维斯,,,,Shortread,统计蒂姆萨克,UTILS
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源包 chipseqr_1.50.0.tar.gz
Windows二进制 chipseqr_1.50.0.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) chipseqr_1.50.0.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipseqr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/chipseqr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/chipseqr/
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