芯片

doi:10.18129/b9.bioc.chipcomp

多个CHIP-SEQ数据集的定量比较

生物导体版本:版本(3.15)

ChipComp在考虑匹配控制的多个条件下检测到差异结合的尖锐结合位点。

作者:Hao Wu,Li Chen,Zhaohui S.Qin,Chi Wang

维护者:li chen

引用(从r内,输入引用(“芯片”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ chipcomp”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“芯片”)

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文本 消息

细节

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版本 1.26.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(7年)
执照 GPL
要看 r(> = 3.2.0),基因组机,,,,iranges,,,,rtracklayer,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS
进口 rsamtools,,,,林玛,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9,,,,生物基因
链接
建议 生物使用,,,,运行
系统要求
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源包 chipcomp_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 chipcomp_1.26.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) chipcomp_1.26.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipcomp
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/chipcomp
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/chipcomp/
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