CancerSubtypes

DOI:10.18129 / B9.bioc.CancerSubtypes

癌症亚型识别、验证和基于多个基因数据集的可视化

Bioconductor版本:版本(3.15)

CancerSubtypes集成了目前常见的计算生物学方法对癌症亚型识别和提供了一个标准化的框架对癌症亚型分析multi-omics数据,如基因表达,microrna的表达、DNA甲基化等。

作者:Taosheng徐(aut (cre)

维护人员:徐Taosheng < Taosheng。在gmail.com x >

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CancerSubtypes”)

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细节

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版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(6年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 4.0),sigclust,NMF
进口	iCluster,集群,嫁祸于,limma,ConsensusClusterPlusgrDevices,生存
链接
建议	BiocGenerics,knitr,RTCGA.mRNA,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/taoshengxu/CancerSubtypes
BugReports	https://github.com/taoshengxu/CancerSubtypes/issues
取决于我
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包档案

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源包	CancerSubtypes_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	CancerSubtypes_1.22.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	CancerSubtypes_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CancerSubtypes
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CancerSubtypes
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CancerSubtypes/
包下载报告	下载数据