癌变分析

DOI：10.18129 / b9.bioc.cancermigedanalysis.

癌症突变分析

Biocometiond版本：释放（3.12）

该套餐实现基因和基因集水平分析方法，用于癌症的体细胞突变研究。基因水平方法区分驾驶员基因（在肿瘤发生中发挥积极作用）和乘客基因（在肿瘤样品中突变，但在肿瘤发生中没有作用）并掺入两阶段的研究设计。该基因设定方法实现了一种以患者为导向的方法，其计算每个样品的基因组分数，然后将它们与样品结合在一起;还提供了一种使用Wilcoxon试验的基因取向方法进行比较。

作者：吉瓦尼Parmigiani，Simina M. Boca

维护者：Simina M.Boca

安装

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if（！perceneNameSpace（“BiocManager”，静静= True））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“cancermitignalysis”）

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文件

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PDF.	r script.	cancermitigateanalysistutorial.
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细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	1.32.0
在生物导体中以来	BIOC 2.10（R-2.15）（9年）
执照	gpl（> = 2）+文件执照
依靠	r（> = 2.10.0），QValue.
进口	annotationdbi.那林马，方法，统计数据
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源包	cancermitionanalysis_1.32.0.tar.gz.
Windows二进制文件	cancermitionanalysis_1.32.0.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	cancermitionanalysis_1.32.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocondudard.org/packages/cancermitigedanalysis.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包/癌症
包短网址	https://biocondudard.org/packages/cancermigedanalysis/
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