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CSSQ
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DOI:10.18129 / B9.bioc.CSSQ
芯片序列信号量化器管道
生物导体版本:发布(3.13)
此包旨在执行统计分析，以识别多组ChIP-seq数据集之间在统计上显著的差异绑定区域。
作者:Ashwath Kumar [aut]， Michael Y Hu [aut]， Mei Yajun [aut]， Fan Yuhong [aut]
维护人员:佐治亚理工学院风机实验室<雨虹。风扇在biology.gatech.edu >
引文(从R中输入引用(“CSSQ”)):
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!安装。packages("BiocManager")
有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“CSSQ”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 介绍CSSQ |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.4.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.11 (R-4.0)(1年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | SummarizedExperiment,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors,rtracklayer |
| 进口 | GenomicAlignments,GenomicFeatures,Rsamtools,ggplot2， grDevices, stats, utils |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | CSSQ_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | CSSQ_1.4.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | CSSQ_1.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CSSQ |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CSSQ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CSSQ/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
