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CNVrd2
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DOI:10.18129 / B9.bioc.CNVrd2
CNVrd2:一种基于读深的方法，用于从下一代测序数据中检测复杂的常见拷贝数变异并进行基因分型。
Bioconductor版本:发行版(3.16)
CNVrd2利用下一代测序数据测量多个样本的人类基因拷贝数，识别标记拷贝数变体的snp，并检测拷贝数多态性基因组区域。
作者:黄檀阮，托尼R梅里曼和米克布莱克
维护:Hoang Tan Nguyen
引文(从R内，输入引用(“CNVrd2”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CNVrd2")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“CNVrd2”)
| R脚本 | Markdown Vignette与针织 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.36.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(9.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R(>= 3.0.0)，方法，VariantAnnotation平行,rjags，ggplot2，gridExtra |
| 进口 | DNAcopy，IRanges，Rsamtools |
| 链接 | |
| 建议 | knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/hoangtn/CNVrd2 |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | CNVrd2_1.36.0.tar.gz |
| Windows二进制 | CNVrd2_1.36.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | CNVrd2_1.36.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | CNVrd2_1.36.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CNVrd2 |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CNVrd2 |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/CNVrd2/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CNVrd2/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
