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- Bioconductor 3.16
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CNViz
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DOI:10.18129 / B9.bioc.CNViz
拷贝数可视化
Bioconductor版本:版本(3.16)
CNViz需要探测、基因和segment-level log2拷贝数比率和启动一个闪亮的应用可视化样本的拷贝数。你也可以集成杂合性丢失(LOH)和单核苷酸变异(SNV)数据。
作者:丽贝卡·格林布拉特(aut (cre)
维护人员:丽贝卡·格林布拉特<丽贝卡。格林布拉特在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“CNViz”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CNViz”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“CNViz”)
| HTML | R脚本 | CNViz |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
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| 版本 | 1.6.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 4.0),闪亮的(> = 1.5.0) |
| 进口 | dplyrgrDevices统计,跑龙套,情节,karyoploteR,CopyNumberPlots,GenomicRanges,magrittr,DT,尺度、图形 |
| 链接 | |
| 建议 | rmarkdown,knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | CNViz_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | CNViz_1.6.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | CNViz_1.6.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | CNViz_1.6.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CNViz |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CNViz |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/CNViz/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CNViz/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
