cnvranger
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.cnvranger
CNV范围的摘要和表达/表型关联
生物导体版本：版本（3.15）
CNVRANGER软件包实施了用于CNV分析的综合工具套件。这包括用于总结一个人群中各个CNV调用的功能，评估与功能基因组区域的重叠以及与基因表达和定量表型的关联分析。
作者：路德维希·盖斯特林格[AUT，CRE]，Vinicius Henrique da Silva [aut]，Marcel Ramos [CTB]，Levi Waldron [CTB]
维护者：hms.harvard.edu>的路德维格·盖斯林格
引用（从r内，输入引用（“ cnvranger”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ CNVRANGER”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ cnvranger”）
| html | R脚本 | CNV范围的汇总和定量性状分析 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.9（R-3.6）（3年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | 基因组机，，，，破烂的经历 |
| 进口 | 生物基因，，，，生物比较，，，，GDSARRAY，，，，GenomeInfodB，，，，iranges，，，，S4VECTORS，，，，Snprelate，，，，总结性特征，，，，Data.Table，，，，EDGER，，，，GDSFMT，grdevices，格子，，，，林玛， 方法，plyr，，，，QQMAN，，，，Rappdirs，，，，RESHAPE2，统计，utils |
| 链接 | |
| 建议 | AnnotationHub，，，，bsgenome.btaurus.ucsc.bostau6.masked，，，，生物使用，，，，复杂的图像，，，，GVIZ，，，，多亚sayExexperiment，，，，tcgautils，，，，策展，，，，Ensembldb， 网格，尼特，，，，区域人，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/waldronlab/cnvranger/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | cnvranger_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cnvranger_1.12.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | cnvranger_1.12.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cnvranger |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/cnvranger |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cnvranger/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
