CNORfeeder

DOI:10.18129 / B9.bioc.CNORfeeder

集成CellNOptR以添加缺失的链接

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该软件包集成了文献约束和数据驱动的方法,从扰动实验推断信号网络。它允许扩展给定的网络,通过各种推断方法从数据中获得链接,并使用蛋白质物理相互作用的信息来指导和验证链接的整合。

作者:Federica Eduati [aut], Enio Gjerga [ctb], Attila Gabor [cre]

维护者:Attila Gabor < Attila。Gabor在uni-heidelberg.de>

引文(从R内,输入引用(“CNORfeeder”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“CNORfeeder”)

PDF R脚本 主要插图:使用cnnorfeeder玩网络
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

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版本 1.38.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(10年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.6.0),CellNOptR(> = 1.4.0),
进口
链接
建议 minetcatnet,RgraphvizRUnitBiocGenericsigraph
SystemRequirements
增强了 MEIGOR
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 CNORfeeder_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 CNORfeeder_1.38.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) CNORfeeder_1.38.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) CNORfeeder_1.38.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CNORfeeder
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CNORfeeder
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/CNORfeeder/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/CNORfeeder/
软件包下载报告 下载数据

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R/凹口包和文档

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网