doi:10.18129/b9.bioc.cand

执行染色体血统差异(CAND)分析

生物导体版本:版本(3.15)

在一组祖先比例上执行CAND测试的功能。对于特定的祖先亚群,用户将为每个样品以及感兴趣的每个染色体或染色体段提供估计的祖先比例。每个测试将返回每个染色体以及总体CAND P值的P值。绘图功能也可用。

作者:凯特琳·麦克休,蒂莫西·桑顿

维护者:caitlin mchugh

引用(从r内,输入引用(“ cand”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ cand”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Cand”)

PDF R脚本 用“ CAND”包装检测跨染色体的种群结构的异质性
PDF 参考手册

细节

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版本 1.27.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(7年)
执照 艺术2.0
要看
进口 方法,GGPLOT2,,,,重塑
链接
建议 运行,,,,生物基因,,,,生物使用
系统要求
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源包 cand_1.27.0.tar.gz
Windows二进制 cand_1.27.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) cand_1.27.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cand
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/cand
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/cand/
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