狂欢节

DOI:10.18129 / B9.bioc.CARNIVAL

使用整数值编程的网络识别(从基因表达数据)的因果推理工具

Bioconductor版本:发行版(3.16)

由Melas等人在R中升级的因果推理工具，从PROGENy得分中更新tf的权重分配。优化参数可自由调整，可获得多个解并聚合。

作者:Enio Gjerga [aut]， Panuwat Trairatphisan [aut]， Anika Liu [ctb]， Alberto Valdeolivas [ctb]， Nikolas Peschke [ctb]， Aurelien Dugourd [ctb]， Attila Gabor [cre]， Olga Ivanova [aut]

维护者:Attila Gabor < Attila。Gabor在uni-heidelberg.de>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“狂欢节”)

超文本标记语言	R脚本	使用CARNIVAL从表达足迹中构建大规模信号网络
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	2.8.0
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0)
进口	readr，stringr，lpSolve，igraph，dplyr，宠物猫，tidyr，rjson，rmarkdown
链接
建议	RefManageR，BiocStyle，covr，knitr，testthat(> = 3.0.0),sessioninfo
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/saezlab/CARNIVAL
BugReports	https://github.com/saezlab/CARNIVAL/issues
全靠我
进口我	cosmosR
建议我	dce
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CARNIVAL_2.8.0.tar.gz
Windows二进制	CARNIVAL_2.8.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	CARNIVAL_2.8.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	CARNIVAL_2.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CARNIVAL
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CARNIVAL
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/CARNIVAL/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CARNIVAL/
软件包下载报告	下载数据