气泡

doi:10.18129/b9.bioc.bubbletree

Bubbletree:使用下一代测序数据阐明体细胞镶嵌的直观可视化,以阐明肿瘤性非整倍性和克隆性

生物导体版本:版本(3.15)

肿瘤样品组中的CNV分析。

作者:Wei Zhu ,Michael Kuziora ,todd creasy ,brandon higgs >

维护者:todd creasy ,wei zhu >

引用(从r内,输入引用(“ Bubbletree”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Bubbletree”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

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Browsevignettes(“ Bubbletree”)

html R脚本 Bubbletree教程
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文本 消息

细节

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版本 2.26.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(7年)
执照 LGPL(> = 3)
要看 r(> = 3.5),iranges,,,,基因组机,,,,plyr,,,,dplyr,,,,马格里特
进口 生物基因(> = 0.31.6),生物使用,,,,生物酶,,,,GGPLOT2,,,,writexls,,,,gtools,,,,rcolorbrewer,,,,林玛, 网格,gtable,,,,栅格,,,,Biovizbase,,,,E1071,方法,grdevices,统计,utils
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown
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源包 bubbletree_2.26.0.tar.gz
Windows二进制 bubbletree_2.26.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) bubbletre_2.26.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bubbletree
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/bubbletree
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/bubbletree/
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