BrainSABER

DOI:10.18129 / B9.bioc.BrainSABER

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Brain Span Atlas in Biobase Expressionset R工具集

Bioconductor版本:发行版(3.16)

艾伦脑科学研究所提供了一个RNA测序(RNA- seq)数据资源，用于研究与人类大脑发育有关的转录机制，称为BrainSpan。BrainSABER是一个R包，通过为两个数据集生成动态相似热图，可以方便地将用户数据与BrainSpan图集中发现的不同发育阶段和大脑结构进行比较。它还为用户数据提供了一个自我验证的容器。

作者:Carrie Minette [aut]， Evgeni Radichev [aut]，美国生物医学工程[aut, cre]

维护者:USD生物医学工程

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BrainSABER”)

超文本标记语言	R脚本	BrainSABER
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.1.0)，biomaRt，SummarizedExperiment
进口	data.table，文理学院、方法、S4Vectors跑龙套,BiocFileCache，闪亮的
链接
建议	BiocStyle，ComplexHeatmap，fastcluster，的热图，knitr，情节，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BrainSABER_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	BrainSABER_1.8.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	BrainSABER_1.8.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	BrainSABER_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BrainSABER
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BrainSABER
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BrainSABER/
软件包下载报告	下载数据