生物兴奋

doi:10.18129/b9.bioc.biocsingular

生物导管包的单数值分解

生物导体版本:版本(3.13)

在一个框架中实现了奇异值分解和主组件分析的精确和近似方法,该框架可以轻松地在生物处理程序包或工作流程中切换。在可能的情况下,使用BioCparallealer框架实现并行化。

作者:Aaron Lun [AUT,CRE,CPH]

维护者:aaron lun

引用(从r内,输入引用(“生物旋转”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ biocsingular”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“生物刺激”)

html R脚本 1. SVD和PCA
html R脚本 2.矩阵类
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.8.1
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(2年)
执照 GPL-3
要看
进口 生物基因,,,,S4VECTORS,,,,矩阵,方法,utils,延迟,,,,生物比较,,,,scaledmatrix,,,,irlba,,,,RSVD,,,,RCPP,,,,beachmat
链接 RCPP,,,,beachmat
建议 测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,残留matrix
系统要求 C ++ 11
增强
URL https://github.com/ltla/biocsingular
BugReports https://github.com/ltla/biocsingular/issues
取决于我 carpartmap
进口我 Batchelor,,,,BAYESSPACE,,,,簇发酵,,,,GSVA,,,,米洛,,,,mumosa,,,,新浪潮,,,,PCATOOLS,,,,评分,,,,scdblfinder,,,,Scmerge,,,,斯克兰,,,,scry,,,,辛格,,,,Velociraptor
建议我 HCADATA,,,,残留matrix,,,,scaledmatrix,,,,飞溅
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Biocsingular_1.8.1.tar.gz
Windows二进制 Biocsingular_1.8.1.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) Biocsingular_1.8.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biocsingular
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/biocsingular
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/biocsingular/
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