生物导体版本:版本(3.13)
在一个框架中实现了奇异值分解和主组件分析的精确和近似方法,该框架可以轻松地在生物处理程序包或工作流程中切换。在可能的情况下,使用BioCparallealer框架实现并行化。
作者:Aaron Lun [AUT,CRE,CPH]
维护者:aaron lun
引用(从r内,输入引用(“生物旋转”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ biocsingular”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“生物刺激”)
html | R脚本 | 1. SVD和PCA |
html | R脚本 | 2.矩阵类 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.8.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.9(R-3.6)(2年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | |
进口 | 生物基因,,,,S4VECTORS,,,,矩阵,方法,utils,延迟,,,,生物比较,,,,scaledmatrix,,,,irlba,,,,RSVD,,,,RCPP,,,,beachmat |
链接 | RCPP,,,,beachmat |
建议 | 测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,残留matrix |
系统要求 | C ++ 11 |
增强 | |
URL | https://github.com/ltla/biocsingular |
BugReports | https://github.com/ltla/biocsingular/issues |
取决于我 | carpartmap |
进口我 | Batchelor,,,,BAYESSPACE,,,,簇发酵,,,,GSVA,,,,米洛,,,,mumosa,,,,新浪潮,,,,PCATOOLS,,,,评分,,,,scdblfinder,,,,Scmerge,,,,斯克兰,,,,scry,,,,辛格,,,,Velociraptor |
建议我 | HCADATA,,,,残留matrix,,,,scaledmatrix,,,,飞溅 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Biocsingular_1.8.1.tar.gz |
Windows二进制 | Biocsingular_1.8.1.zip(32-和64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | Biocsingular_1.8.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biocsingular |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/biocsingular |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/biocsingular/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
Bioc 3.13的旧源软件包 | 来源存档 |