Bioconcotk

doi:10.18129/b9.bioc.bioconcotk

一般癌症基因组学的生物导体成分

生物导体版本:版本(3.15)

为癌症研究的基因组规模分析提供了各种工具的中心界面。

作者:文斯·凯里

维护者:vj Carey

引用(从r内,输入引用(“ Bioconcotk”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Bioconcotk”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Bioconcotk”)

html R脚本 Bioconcotk-生物导体的癌症成分
html R脚本 策展码头概述
html R脚本 将TCGA肿瘤代码映射到NCIT
PDF 参考手册

细节

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版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(4年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.6.0),方法,utils
进口 复杂的图像,,,,S4VECTORS,,,,Bigrquery,,,,闪亮的,统计httr,,,,rjson,,,,dplyr,,,,马格里特, 网格,DT,,,,基因组机,,,,iranges,,,,GGPLOT2,,,,总结性特征,,,,DBI,,,,GenomicFeatures,,,,策展,,,,,,,,ggpubr,,,,plyr,,,,,,,,图形,,,,rgraphviz
链接
建议 尼特,,,,dbplyr,,,,org.hs.eg.db,,,,多亚sayExexperiment,,,,生物使用,,,,Ontoproc,,,,本体学图,,,,pogos,,,,GenomeInfodB,,,,安息(> = 1.3.7),Biocfilecache,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,生物酶,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg18.nown,,,,RESHAPE2,,,,测试,,,,AnnotationDbi,,,,FDB.Infinium -Methylation.hg19,,,,ensdb.hsapiens.v75,,,,rmarkDown,,,,Rhdf5client
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

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源包 Bioconcotk_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 bioconcotk_1.16.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Bioconcotk_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioconcotk
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/bioconcotk
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/bioconcotk/
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