生物导体版本:版本(3.15)
为癌症研究的基因组规模分析提供了各种工具的中心界面。
作者:文斯·凯里
维护者:vj Carey
引用(从r内,输入引用(“ Bioconcotk”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Bioconcotk”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Bioconcotk”)
html | R脚本 | Bioconcotk-生物导体的癌症成分 |
html | R脚本 | 策展码头概述 |
html | R脚本 | 将TCGA肿瘤代码映射到NCIT |
参考手册 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.16.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.7(R-3.5)(4年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.6.0),方法,utils |
进口 | 复杂的图像,,,,S4VECTORS,,,,Bigrquery,,,,闪亮的,统计httr,,,,rjson,,,,dplyr,,,,马格里特, 网格,DT,,,,基因组机,,,,iranges,,,,GGPLOT2,,,,总结性特征,,,,DBI,,,,GenomicFeatures,,,,策展,,,,秤,,,,ggpubr,,,,plyr,,,,车,,,,图形,,,,rgraphviz |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,dbplyr,,,,org.hs.eg.db,,,,多亚sayExexperiment,,,,生物使用,,,,Ontoproc,,,,本体学图,,,,pogos,,,,GenomeInfodB,,,,安息(> = 1.3.7),Biocfilecache,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,生物酶,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg18.nown,,,,RESHAPE2,,,,测试,,,,AnnotationDbi,,,,FDB.Infinium -Methylation.hg19,,,,ensdb.hsapiens.v75,,,,rmarkDown,,,,Rhdf5client |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Bioconcotk_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | bioconcotk_1.16.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | Bioconcotk_1.16.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioconcotk |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/bioconcotk |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/bioconcotk/ |
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