生物脑

doi：10.18129/b9.bioc.biocneighbors

最近的邻居检测到生物通用包装

生物导体版本：版本（3.15）

在一个框架中，可以轻松地在生物处理器软件包或工作流程中切换它们的框架，以实现准确的近似方法。可以使用K-Means对K-Nearest邻居算法或具有优势点树进行精确搜索。可以使用烦恼或HNSW库进行近似搜索。支持在欧几里得或曼哈顿距离上进行搜索。通过使用BioCparallel，可以实现所有方法的并行化。还提供了功能来搜索给定距离内的所有邻居。

作者：Aaron Lun [AUT，CRE，CPH]

维护者：aaron lun

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Biocneighbors”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Biocneighbors”）

html	R脚本	1.检测确切的最近邻居
html	R脚本	2.检测大约最近的邻居
html	R脚本	3.检测范围内的邻居
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载
版本	1.14.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁）
执照	GPL-3
要看
进口	RCPP，，，，S4VECTORS，，，，生物比较，统计，方法，矩阵
链接	RCPP，，，，rcpphnsw
建议	测试，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，fnn，，，，rcppannoy，，，，rcpphnsw
系统要求	C ++ 11
增强
URL
取决于我	OSCA.Advanced，OSCA.Workflows
进口我	Batchelor，，，，Bluster，，，，细胞混蛋，，，，Cydar，，，，细胞动力，，，，Imcrtools，，，，米洛，，，，mumosa，，，，评分，，，，scdblfinder，，，，辛格
建议我	轨迹，，，，TSCAN
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Biocneighbors_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	biocneighbors_1.14.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	Biocneighbors_1.14.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biocneighbors
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/biocneighbors
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/biocneighbors/
软件包下载报告	下载统计