BiocFileCache

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocFileCache

跨会话管理文件

Bioconductor版本:发行版(3.15)

这个包创建用户可以添加、更新和检索的文件的持久磁盘缓存。它对于管理创建成本高或难度大的资源(如自定义Txdb对象)、web资源和跨会话使用的数据文件非常有用。

作者:Lori Shepherd [aut, cre]， Martin Morgan [aut]

维护者:Lori Shepherd < Lori。谢博德:roswellpark.org>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BiocFileCache")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“BiocFileCache”)

超文本标记语言	R脚本	跨会话管理文件资源
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	测试盒框
在Bioconductor公司	BioC 3.5 (R-3.4)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4.0)，dbplyr(> = 1.0.0)
进口	方法，统计，效用，dplyr,RSQLite,DBI,rappdirs,filelock,旋度,httr
链接
建议	testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown,rtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Bioconductor/BiocFileCache/issues
全靠我	AnnotationHub,ExperimentHub,JASPAR2022,RcwlPipelines,scATAC。资源管理器,TMExplorer
进口我	意大利苦杏酒,atSNP,自治,BayesSpace,BiocPkgTools,biodb,biomaRt,BioPlex,BrainSABER,brendaDb,bugsigdbr,cbaf,cBioPortalData,CellBench,conclus,CTDquerier,customCMPdb,dasper,drugTargetInteractions,easyRNASeq,enhancerHomologSearch,EnMCB,EnrichmentBrowser,EpiTxDb,fgga,GAPGOM,GenomicScores,GenomicSuperSignature,GRaNIE,GSEABenchmarkeR,gwascat,杂环胺,MBQN,netDx,NxtIRFcore,NxtIRFdata,奥得河,ontoProc,org.Mxanthus.db,Organism.dplyr,PANTHER.db,PhIPData,psichomics,recount3,recountmethylation,regutools,RiboDiPA,rpx,芝麻,SingleCellMultiModal,SingscoreAMLMutations,SpatialExperiment,spatialHeatmap,spatialLIBD,terraTCGAdata,TFutils,tomoseqr,tximeta,UMI4Cats,uncoverappLib,UniProt.ws,waddR
建议我	AnnotationForge,bambu,BiocOncoTK,BiocSet,chipseqDB,emtdata,EpiCompare,fastreeR,火焰,fluentGenomics,HiCDCPlus,HighlyReplicatedRNASeq,HumanTranscriptomeCompendium,MethReg,MethylSeqData,msigdb,Nebulosa,后代,qsvaR,scRNAseq,seqsetvis,simpleSingleCell,structToolbox,TCGAutils,TENxBrainData,TENxPBMCData,TimeSeriesExperiment,TREG,zellkonverter
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	BiocFileCache_2.4.0.tar.gz
Windows二进制	BiocFileCache_2.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	BiocFileCache_2.4.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/BiocFileCache
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BiocFileCache
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocFileCache/
软件包下载报告	下载数据