Bioqc
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.bioqc
检测具有基因集表达谱的组织异质性
生物导体版本：版本（3.15）
BIOQC基于组织基因特征对高通量表达数据进行质量控制。它可以检测基因表达数据中的组织异质性。核心算法是Wilcoxon-Mann-Whitney测试，针对高性能进行了优化。
作者：Jitao David Zhang [Cre，Aut]，Laura Badi [AUT]，Gregor Sturm [Aut]，Roland Ambs [Aut]，Iakov Davydov [aut]
维护者：Jitao David Zhang
引用（从r内，输入引用（“ BioQC”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ BioQC”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Bioqc”）
| html | R脚本 | BIOQC算法：加快Wilcoxon-Mann-Whitney测试 |
| html | R脚本 | BIOQC基准：BIOQC对模拟和现实世界数据的测试效率，灵敏度和特异性 |
| html | R脚本 | Bioqc-kidney：肾脏表达例子 |
| html | R脚本 | BIOQC：检测基因表达数据中的组织异质性 |
| html | R脚本 | 将Wilcoxon-Mann-Whitney与替代统计测试进行比较 |
| html | R脚本 | 将BIOQC与签名基因组一起使用 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.24.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（6。5年） |
| 执照 | GPL（> = 3） +文件执照 |
| 要看 | r（> = 3.5.0），生物酶 |
| 进口 | EDGER，，，，RCPP，方法，统计，utils |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | 测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，格子，，，，LatticeExtra，，，，rbenchmark，，，，GPLOTS，，，，栅格，，，，org.hs.eg.db，，，，hgu133plus2.db，，，，GGPLOT2，，，，RESHAPE2，，，，plyr，，，，ineq，，，，COVR，，，，林玛，，，，rcolorbrewer |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://accio.github.io/bioqc |
| BugReports | https://accio.github.io/bioqc/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | bioqc_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | bioqc_1.24.0.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | bioqc_1.24.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioqc |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/bioqc |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/bioqc/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
