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BioMM
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DOI:10.18129 / B9.bioc.BioMM
BioMM:使用组学数据进行表型预测的生物知情多阶段机器学习框架
Bioconductor版本:发行版(3.13)
从高维组学数据中识别可重复的生物模式是理解复杂疾病或性状的生物学的关键因素。将现有的生物学知识整合到机器学习中是推进此类研究的重要一步。我们提出了一个生物信息的多阶段机器学习框架，称为BioMM，专门用于基于组学尺度数据的表型预测，我们可以使用先验生物元信息评估不同的机器学习模型。
作者:陈俊芳，Emanuel Schwarz
维护者:Junfang Chen < Junfang。陈33在gmail.com>
引文(从R内，输入引用(“BioMM”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("BioMM")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“BioMM”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | BioMMtutorial |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.9 (R-3.6)(2年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 3.6) |
| 进口 | stats, utils, grDevices，晶格，BiocParallel，glmnet，rms，precrec，nsprcomp，管理员，e1071，ggplot2，vioplot，CMplot，成像仪，topGO，xlsx |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，RUnit，BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | BioMM_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | BioMM_1.8.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | BioMM_1.8.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioMM |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BioMM |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BioMM/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
