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BiGGR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.BiGGR
在R中使用代谢重建数据库进行基于约束的建模
Bioconductor版本:Release (3.15)
这个包提供了一个接口来模拟来自BiGG数据库(http://bigg.ucsd.edu/)和其他代谢重建数据库的代谢重建。该软件包便于通量平衡分析(FBA)和可行通量分布的采样。代谢网络和估计通量可以用超图可视化。
作者:Anand K. Gavai, Hannes Hettling
维护者:Anand K. Gavai < Anand。Gavai研究生物信息学。nl>， Hannes Hettling < Hannes。Hettling在naturalist, nl>
引文(从R内，输入引用(“BiGGR”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“BiGGR”)
| R脚本 | BiGGR | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.32.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(9年) |
| 许可证 | 文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 2.14.0)，rsbml，hyperdraw，LIM，stringr |
| 进口 | 超图，limSolve |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | //www.anjoumacpherson.com/ |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | BiGGR_1.32.0.tar.gz |
| Windows二进制 | BiGGR_1.32.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiGGR |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BiGGR |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BiGGR/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
