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DOI：10.18129 / b9.bioc.bifet.

无偏见的足迹富集测试

Bioconductor版本：释放（3.13）

双轴识别TFS，与在读取计数和目标和背景区域之间的GC内容的不平衡中产生的偏差之后，与背景区域相比，其占地面积在目标区域中被占用。对于给定的TF k，BIFET测试零假设，即目标区域具有与TF K的足迹具有相同的概率，作为背景区域，同时校正读取计数和GC含量偏压。为此，我们使用具有TF K，T_K的占地面积的目标区域数量作为测试统计，并计算P值作为观察T_K或更多目标区域的概率，其中占用假设下的占地面积。

作者：Ahrim Youn [Aut，Cre]，Eladio Marquez [Aut]，Nathan Lawlor [Aut]，Michael Stitzel [Aut]，Duygu Ucar [Aut]

维护者：Ahrim Youn

安装

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if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“bifet”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	1.12.0
在生物导体中以来	BIOC 3.7（R-3.5）（3年）
执照	GPL-3
依靠
进口	统计数据，poibin.那Genomicranges.
链接到
建议	testthat.那kn
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包档案包

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源包	bifet_1.12.0.tar.gz.
Windows二进制文件	bifet_1.12.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	bifet_1.12.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/bifet.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/双轴
包短网址	https://biocumon.org/packages/bifet/
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