评估员

DOI:10.18129 / b9.bioc.assessorf.

使用蛋白质组学和进化节约评估基因预测

Bioconductor版本:释放(3.13)

为了评估一个基因组的一组预测基因的质量,必须首先将证据映射到该基因组。接下来,必须根据证据对该基因的强烈或反对这种基因进行分类。评估员包提供完成这些任务所需的功能和类结构,使用蛋白质组学命中和进化节约的起始密码子作为证据形式。

作者:Deevank Korandla [Aut,Cre],Erik Wright [Aut]

维护者:Deepann Korandla

引文(从R内,输入引文(“评估员F”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“assessorf”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

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BROWSEVIGNETTES(“Assextorf”)

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Biocviews. bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 1.10.0.
在生物导体中以来 BIOC 3.8(R-3.5)(2.5岁)
执照 GPL-3
依靠 r(> = 3.5.0),解码(> = 2.10.0)
进口 生物仪器Genomicranges.绞喉,图形,grdevices,方法,统计,utils
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源包 ascase orf_1.10.0.tar.gz.
Windows二进制文件 ascaseorf_1.10.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) ascaseorf_1.10.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/assessorf.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/评估员
包短网址 https://biocumon.org/packages/assessorf/
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