- 家
- Bioconductor 3.15
- 软件包
- ArrayExpressHTS
ArrayExpressHTS
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.ArrayExpressHTS
ArrayExpress高通量测序处理管道
Bioconductor版本:版本(3.15)
公共ArrayExpress RNA-Seq处理管道实验或本地数据集
作者:安琪拉Goncalves,安德鲁Tikhonov
维护人员:安吉拉Goncalves < filimon ebi.ac。英国>,安德鲁Tikhonov <安德鲁在ebi.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“ArrayExpressHTS”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ArrayExpressHTS”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ArrayExpressHTS”)
| R脚本 | ArrayExpressHTS: RNA-Seq管道转录分析实验 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.46.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(11年) |
| 许可证 | 艺术授权2.0 |
| 取决于 | 抽样,Rsamtools(> = 1.99.0),雪 |
| 进口 | Biobase,BiocGenerics,Biostrings,GenomicRanges,Hmisc,IRanges(> = 2.13.11),R2HTML,RColorBrewer,Rsamtools,ShortRead,XML,biomaRt,刨边机、grDevices、图形、方法rJava统计数据,svMisc跑龙套,sendmailR,bitops |
| 链接 | Rhtslib(> = 1.15.3) |
| 建议 | |
| SystemRequirements | GNU使 |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ArrayExpressHTS_1.46.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS 10.13(高山脉) | ArrayExpressHTS_1.46.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ArrayExpressHTS |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ArrayExpressHTS |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ArrayExpressHTS/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
