ArrayExpress

doi:10.18129/b9.bioc.ArrayExpress

访问EBI上的ArrayExpress微阵列数据库并构建生物导体数据结构:Expressionset,AffyBatch,NChannelset

生物导体版本:版本(3.15)

访问EBI的ArrayExpress存储库并构建生物导体数据结构:ExpressionSet,AffyBatch,NChannelset

作者:奥黛丽·考夫曼(Audrey Kauffmann),易卜拉欣·埃姆(Ibrahim Emam),迈克尔·舒伯特

维护者:Suhaib Mohammed

引用(从r内,输入引用(“ ArrayExpress”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ arrayExpress”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ arrayExpress”)

PDF R脚本 ArrayExpress:导入并将ArrayExpress数据集转换为R对象
PDF 参考手册

细节

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版本 1.56.0
在生物导体中 Bioc 2.3(R-2.8)(13。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.9.0),生物酶(> = 2.4.0)
进口 XML,,,,奥利戈,,,,林玛
链接
建议 副词
系统要求
增强
URL
取决于我 drugvsdisease,,,,Maendtoend
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建议我 Hiiragi2013
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 arrayexpress_1.56.0.tar.gz
Windows二进制 arrayexpress_1.56.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) arrayexpress_1.56.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/arrayexpress
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/arrayExpress
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/arrayexpress/
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