AneuFinder

DOI:10.18129 / B9.bioc.AneuFinder

拷贝数变异Single-Cell-Sequencing数据分析

Bioconductor版本:版本(3.15)

AneuFinder实现功能人类基因组检测、断点检测,核型和异质性分析单细胞全基因组测序和strand-seq数据。

作者:亚伦Taudt,他比约恩·大卫Porubsky

维护人员:亚伦Taudt <亚伦。在gmail.com taudt >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“AneuFinder”)

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细节

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版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5),GenomicRanges,ggplot2,cowplot,AneuFinderData
进口	方法、跑龙套grDevices、图形数据,foreach,doParallel,BiocGenerics(> = 0.31.6),S4Vectors,GenomeInfoDb,IRanges,Rsamtools,bamsignals,DNAcopy,ecp,Biostrings,GenomicAlignments,reshape2,ggdendro,ggrepel,ReorderCluster,mclust
链接
建议	knitr,BiocStyle,testthat,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ataudt/aneufinder.git
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	AneuFinder_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	AneuFinder_1.24.0.zip(64位)
macOS 10.13(高山脉)	AneuFinder_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AneuFinder
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AneuFinder
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AneuFinder/
包下载报告	下载数据