砧

doi：10.18129/b9.bioc.anvil

砧座环境上的生物导体

生物导体版本：版本（3.15）

砧是国家人类基因组研究所（National Human Genome Research Institute）部分开发的云计算资源。Anvil软件包提供最终用户和开发人员功能。对于最终用户，Anvil提供快速的二进制软件包安装，用于使用Terra / Anvil表和数据资源的UTITLITY以及用于往返Google Cloud Storage的文件移动的方便功能。对于开发bob电竞体育官网人员而言，Anvil提供了对Terra，Leonardo，Rawls，Dockstore和Gen3 Restful编程接口的程序访问，包括用于将JSON响应转换为对R.中更适合R.中的Gemtats的助手功能。

作者：马丁·摩根[AUT，CRE]，Nitesh Turaga [aut]，BJ Stubbs [CTB]，Vincent Carey [CTB]，Marcel Ramos [CTB]，Sehyun OH [CTB]，Sweta Gopaulakrishnan [CTB]，Valerie Obenchain [CTB]

维护者：Martin Morgan

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Anvil”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Anvil”）

html	R脚本	砧座的码头和生物导体
html	R脚本	砧套装简介
html	R脚本	在R中运行砧工作流程
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载
版本	1.8.2
在生物导体中	Bioc 3.11（R-4.0）（2年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.6），dplyr
进口	统计，utils，方法，徒劳，，，，jsonlite，，，，httr，，，，Rapiclient（> = 0.1.3），蒂布尔，，，，tidyselect，，，，花花公子，，，，rlang，，，，生物管理器
链接
建议	平行，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，用，，，，readr，，，，生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我	cbioportaldata，，，，Terratcgadata
进口我	Anvilpublish
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	anvil_1.8.2.tar.gz
Windows二进制	anvil_1.8.2.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Anvil_1.8.2.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/anvil
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/砧
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/anvil/
软件包下载报告	下载统计
Bioc 3.15的旧源软件包	来源存档